could在本例中的功能

A1: Who parked the car there last night?

B1: It could have been Tom.

上面第一组对话没问题。非常不错理解。

A2: Who parked the car there last night?

B2: It could be Tom.

上面第二组对话B2的回答到底的意思是？

既然你对B1无疑问，我只回答B2.

A2: Who parked the car there last night?

B2: It could be Tom.

B2的回答实质是省略了that/who从句的it 分裂句（强调句型）。等于：

It could be Tom who/that parked the car there last night.

当大家用It was Tom...时，大家强调的是一个事实（说话人自觉得自己知道事实真相）。当大家并不知道事实真相，而是表示理论上存在某种可能性时，大家就能用表示can的过去式could表示过去存在的理论上的可能性。注意could的这种使用方法不是推断。

顺便说一下，B1中的could have been则是could表示推断，对过去的推断要用could have done形式。